С приходом советской власти мечеть ненадолго закрыли и превратили в тюрьму, но в 1943 вернули духовенству и разрешили использовать по назначению. Таким образом Джума-мечеть в Дербенте оставалась единственной действующей во всем регионе, из-за чего на пятничный намаз приезжали люди из всех окрестных городов и деревень. Сегодня комплекс состоит из самой мечети, внутреннего двора, жилых помещений и медресе — учебного заведения, где в древности готовили будущих служителей культа, учителей и чиновников.